Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF628Q5EBL2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms