Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SP6Q3SY56 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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