Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms