Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms