Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF8Q3BBV2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF8Q3BBV2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms