Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF1Q3BBV0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms