Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROX2Q3B8N5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms