Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LETM2Q2VYF4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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