Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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