Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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