Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IMPG1Q17R60 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IMPG1Q17R60 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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