Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXT1Q16394 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms