Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms