Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCOA1Q15788 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
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