Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms