Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PCOLCEQ15113 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms