Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms