Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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