Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFTN1Q14699 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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