Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SCARF1Q14162 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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