Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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