Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms