Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC106868.1-201ENST00000505272 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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MKRN4PQ13434 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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MKRN4PQ13434 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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MKRN4PQ13434 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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