Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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