Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CALCOCO2Q13137 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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