Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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