Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COX10Q12887 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms