Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TROQ12816 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TROQ12816 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TROQ12816 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TROQ12816 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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