Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBRQ0VD83 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBRQ0VD83 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms