Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP6Q0PNE2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms