Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM27E3Q08E93 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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