Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms