Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EGR3Q06889 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms