Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 UBE2D3-211ENST00000502404 574 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms