Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC18A2Q05940 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms