Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms