Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ENTPD1-AS1-206ENST00000449197 523 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC090531.1-201ENST00000547168 923 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL121658.1-201ENST00000608489 712 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms