Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms