Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK6Q00534 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK6Q00534 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK6Q00534 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK6Q00534 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms