Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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PKD1P98161 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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