Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63132 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63132 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms