Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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