Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms