Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL23P55773 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms