Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSNK1EP49674 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms