Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP8P40818 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP8P40818 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP8P40818 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP8P40818 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP8P40818 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
USP8P40818 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
USP8P40818 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP8P40818 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP8P40818 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP8P40818 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP8P40818 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms