Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA9P31269 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms