Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms