Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB9P28065 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms