Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VARSP26640 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VARSP26640 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms